Im Vergleich zu 2009, als das Museum am Lindenbühl für die Sanierungsarbeiten seine Pforten geschlossen hatte, ist die Besucherzahl um 25% gestiegen.
Bemerkenswert dabei ist, dass das Museum erst im September 2013 wiedereröffnet worden war. Für überregionales Interesse hat besonders die Ausstellung zur Glaubensgeschichte während der Vorreformation "Umsonst ist der Tod" gesorgt, wie das Museum mitteilte.
Das Mühlhäuser Museum am Lindenbühl gehörte damit 2013 zu den besten Museen in den thüringer Städten.